I avsidesliggende områder av Minecraft-verdenen har det åpnet seg flere portaler hvor det har dukket opp horder av zombier. Nå innhenter de levende døde hæren den ene byen etter den andre. Du i spillet Counter Craft Zombies som soldat i en spesialstyrke-tropp vil måtte engasjere seg med dem i kamp. Før du på skjermen ser du karakteren din, som er i gatene i en av byene. Ved hjelp av kontrolltastene vil du få helten din til å bevege seg fremover. Se nøye rundt. Så snart du oppdager en zombie, sikter du våpenet ditt mot det, og sikter, ild for å drepe. Ved å skyte nøyaktig vil du ødelegge fienden og få poeng for det. Inspiser alt rundt nøye. Se etter cacher som inneholder førstehjelpsutstyr og ammunisjon. Du må samle disse elementene. De vil hjelpe deg i dine fremtidige kamper.