Naruto har lenge ikke vært den urolige tenåringen som ikke kjenner sine evner, men det er fortsatt vanskelig å kalle ham en klok ninjaopplevelse. Likevel har han et lag, og de er klare til å kjempe med de mørke kreftene for retten til å bli en stor shinobi-leder. På scenen av spillet Ninja Runner Runato, kan du hjelpe helten å beseire de neste fiendene, hvis strømning ikke tørker ut. Antallet motstandere er stort, og helten satte fart. Han vil løpe fort, og du får ham til å reagere på møtende hindringer, både animerte og livløse.
