På en fjern planet lever mennesker fremdeles med forskjellige magiske evner. I Prime Alchemist vil du møte en ung tryllekunstner og en alkymistlærling. I dag vil vår karakter på instruksjonene fra læreren måtte gå til en av dalene som er tapt på fjellet og finne gamle gjenstander der. Du vil hjelpe helten din i dette eventyret. Du vil se hvordan karakteren din løper langs veien der forskjellige hindringer venter ham. Ved å bruke hans evne til å magi, kan du få ham til å overvinne dem alle. Når du møter med monstre, slå dem med magiske staver og ødelegge fienden.