Spillet Alien Quarantine finner sted på territoriet til et hemmelig laboratorium hvor det utføres eksperimenter på fangede fremmede skapninger. En av romvesenene klarte å komme seg løs, han frigjorde de andre og virkelig kaos begynte i laboratoriet. Helten i spillet Alien Quarantine blir sendt på rekognosering, men står overfor en farlig fiende. Han må gjenopprette sikkerhetssystemet for å forhindre at monstre bryter seg inn i andre sektorer. For å gjøre dette, må du aktivere flere enheter, flytte og skyte, unngå fremmede angrep.
