Helten i spillet Shinobi Swarm vil bruke alle typer nærkampsvåpen, og med din hjelp vil han raskt lære superevner og være i stand til å avvise angrep fra en sverm av monstre. Dette er nødvendig for å overleve, ellers vil shinobien møte den sikre døden. Han ankom ødemarken for rekognosering, hovedaktiviteten hans er spionasje, ninjaen er ikke vant til å tiltrekke seg oppmerksomhet ved å opptre stille. Men denne gangen kom ting ut av kontroll. Monstrene kjente levende kjøtt og kunne ikke stoppes. Mellom angrepene, velg superevner eller supervåpen for å overleve i Shinobi Swarm.
