Folk blir syke og det er ingen flukt fra det, så farmakologer jobber utrettelig, og leger propper pasienter med piller. I spillet Pill Puzzler vil du også bli med i denne kontinuerlige prosessen og først må du forberede piller slik at du har noe å gi pasientene. Gå inn i laboratoriet og flerfargede tabletter vil vises på brettet. Du må fordele dem i bokser i et minimum antall trekk, og deretter gå til sykehuset for å ta imot pasienter. Gi alle det de er foreskrevet og raskt, de vil ikke vente. Ved å bruke inntektene kan du utstyre et legekontor i Pill Puzzler.