Hele Mystic Investigation Agency-teamet må være involvert i spillet Scooby-Doo og Guess Who? Monster Mayhem. Faktum er at alle monstrene har rømt fra Ghost Museum i Crystal Bay og bare teamet til Scooby-Doo og vennene hans kan fange og, viktigst av alt, ødelegge flyktningene. Men de trenger din makt, ikke som monsterjeger, men som øverstkommanderende for en forsvarsstrategi. Foran deg er hvert medlem av byrået, og en vei strekker seg fra ham. Monstre kommer ut av døren og kan bevege seg langs hvilken som helst vei. Nedenfor velger du måter å stoppe ham på og plassere monstre i veien for ham i Scooby-Doo og Gjett hvem? Monsterkaos.