I Wizard School-spillet vil du gå til en verden hvor det fortsatt blir født barn som har forskjellige magiske evner. For å lære å bruke dem går de på en spesialskole for tryllekunstnere. Karakteren din vil også starte reisen sin som student i den. Han må lære å bruke en magisk stav og bruke forskjellige trollformler. For å gjøre dette, må han utføre oppgaver som vil bli gitt ham av lærere. For at karakteren skal takle oppgavene i spillet, er det hint. Du vil bli indikert av rekkefølgen av handlingene dine. Ved å følge dem vil du kunne fullføre alle oppgavene og bli en tryllekunstner. Etter det vil du som lærer ved samme skole kunne utvikle ditt eget stavesystem og undervise andre elever.