Etter å ha blitt utsatt for stråling, skaffet Stickman seg superkrefter og bestemte seg for å bli en helt. Men først må han trene på å mestre evnene sine. I Stickman Training Hero vil du hjelpe ham å trene. I begynnelsen av spillet vil ikoner vises foran deg. Hver av dem er ansvarlig for sin egen type trening. Det kan være løping, hånd-til-hånd-kamp og mye mer. Du kan velge typen du trenger ved å klikke på musen. For eksempel vil den kjøre. Etter det vil helten din være på veien og løpe langs den gradvis få fart. Du vil bruke kontrolltastene for å få Stickman til å løpe rundt hindringer på siden eller hoppe over dem. Du må også samle forskjellige gjenstander spredt over alt.