En ond og gal forsker stjal en familieoppskrift for å lage pizza fra en berømt kokk i byen som heter Mario. Den galne vil gi pizza spesielle kvaliteter og få den til å jakte på mennesker. Vår helt bestemte seg for å gå inn i forskerens slott og stjele oppskriften hans. Du i spillet Pizza Tower vil hjelpe ham i dette. Foran deg på skjermen vil du se slottet som karakteren din vil være i. Han vil ha et spesielt våpen i hendene. Ved hjelp av kontrolltastene vil du få helten din til å bevege seg fremover. På vei vil han komme over hindringer som han trenger å klatre opp. Han må også omgå forskjellige typer feller som er installert i slottet. Så snart du møter et pizzamonster, må du åpne ild mot det. Ved å skyte nøyaktig vil du ødelegge det og få poeng for det.