I den fjerde delen av Super Mario Advance 4 vil du fortsette å reise med rørlegger Mario gjennom den fantastiske verdenen han befinner seg i. Helten din må gå gjennom mange steder og samle en rekke gjenstander spredt overalt. På veien vil forskjellige feller vente på ham. Noen av dem vil helten din måtte hoppe over, og noen vil han kunne omgå. Dessuten vil helten din komme over monstre som vil prøve å drepe ham. Du må gjøre det slik at helten din hopper på hodet. Dermed vil han ødelegge dem og få poeng for det.
