Den godmodig rørleggeren Mario har en rival - den listige og listige Vario. Han konkurrerer stadig med helten av en eller annen grunn. I det skjulte vil han ta plass til Mario i Mushroom Kingdom, nærmere den vakre prinsessen Peach. Forleden foreslo den lure fyren at rørleggeren skulle holde løpekonkurranse. For å vinne må du være den første til å nå det røde flagget og hoppe behendig over hindringer. Hjelp Mario, du vil ikke at Vario skal vinne. Mens du løper, prøv å ikke gå glipp av mynter. Dette er ikke bare gull, men en måte å få fart på helten, han vil løpe mye raskere med en mynt i lommen. Hvis helten snubler over et hinder, vil han være tilbake i starten av Super Mario vs Wario.