Et dunkelt føll med navnet Spirit har vokst til en vakker fullblodshest. En gang klarte han å rømme fra ranchen, og nå er han fri. Han reiser verden rundt, får venner, og du vil møte ham i Horse Run 3D, der han møtte en søt jente og gikk med på å ri seg selv en stund for å hjelpe jenta å flykte fra sin onde stemor. Hjelp heltene, hesten må skynde seg langs de trange gatene i en liten by. På veien vil du komme over forskjellige hindringer som må unngås eller hoppe over, samle mynter og epler for å etterfylle dyrets styrke.
