Pilpuslespillet har blitt litt modifisert i Flower Arrow Puzzle, selv om reglene ikke er endret. Piler har erstattet flerfargede blomsterhoder, og de vil bli guider i dette spillet. Ved å klikke på pilen vil den begynne å bevege seg i retningen der blomsten peker. Hvis det er en annen pil i veien, blir det en kollisjon og du vil miste hjertet. Det er tre av dem totalt. Med hvert nivå vil et økende antall piler dukke opp på banen, de fletter seg sammen og dette gjør oppgaven i Flower Arrow Puzzle vanskeligere.
