Mange mennesker tror på tilstedeværelsen av andre verdens krefter, og enda mer er interessert i temaet paranormale fenomener. Heltinnen i spillet Tombstone Secrets vurderer alt dette komplette tullet og i hennes yrke foretrekker detektiv å tro bare reelle fakta. Da hun fikk saken om spøkelser på byens kirkegård, påtok hun seg å undersøke ham uten frykt. Imidlertid vil omstendighetene snart tvinge henne til å endre sin mening. Jenta vil jobbe par med vaktmesteren på kirkegården Thomas, som, i motsetning til detektivjenta, ikke bare tror på spøkelser, men også så dem. Bli med paret og hjelp dem i etterforskningen i gravsteinshemmeligheter.
