En pirat-kjeltling ved navn Karl var berømt for sin grusomhet og list i hele Middelhavet, det virket som om ingen kunne overliste ham. Selv mannskapet hans hadde lenge ønsket å kaste ham fra kapteinens bro, men de klarte det fortsatt ikke. Karl undertrykte opptøyene i tide og straffet opprørerne hardt. Men alt kommer til en slutt, og i Pirate Cutthroat Carl Escape fant piraten seg fanget. De klarte likevel å lure ham og låse ham inne i en hytte på en øde øy. Skipet og dets mannskap seilte raskt avgårde i ukjent retning, og den tidligere kapteinen ble alene. Han må begynne på nytt, men først må han komme seg ut av hytta i Pirate Cutthroat Carl Escape.
