Mens han etterforsket en annen sak, fant helten i spillet Mystery Subway Escape 2, detektiv Michael, en hemmelig inngang til forlatte T-banestasjoner. De færreste vet om dem. Vi snakker ikke om tekniske tunneler, men om stasjoner som en gang var i drift, men av en eller annen grunn viste seg å være stengt og uavhentet. Det var noe utstyr, ting og gjenstander igjen der som ikke ble kastet fordi de fortsatt kan være nyttige. Det er der helten vår vil se etter bevis, og deretter en vei ut, siden døren der han kom inn ble låst av noen i Mystery Subway Escape 2. Tilsynelatende så de på ham og bestemte seg for å kvitte seg med den nitidige detektiven.
