Det finnes forlatte byer, og dette er et velkjent faktum, men du kunne aldri forestille deg at du ville finne deg selv i en av dem i Mystery Town Escape. Dagen før bestemte du deg for å besøke familien din, hoppet inn i bilen og kjørte ut på veien. Veien var kjent og tok vanligvis ikke mer enn fire timer. Men etter å ha kjørt halvveis kom du plutselig over reparasjonsarbeid og veiskilt viste en omkjøring langs en grusvei, som kunne strekke seg i flere kilometer. Halve veien er passert, du vil ikke tilbake, så du gikk videre. Veien viste seg å være ukjent og stadig mer illevarslende, og snart dukket det opp en by i horisonten. Du bestemmer deg for å stoppe, få deg noe å spise og fylle bensin. Men byen viste seg å være helt tom og falleferdig. Hvor du kan få tak i drivstoff og mat er et problem i Mystery Town Escape.