På en avsidesliggende øy et sted i havet, vekk fra nysgjerrige øyne, er det et hemmelig laboratorium hvor eksperimenter utføres på genetisk nivå. Her i Merge Animals - Mutant Fight lages monstre, og du vil bli med på å lage dem. Et fullverdig monster må se skremmende ut og kunne stå opp for seg selv, så etter at mutanten er skapt, må den testes. Skapelsen din må delta i en duell med en annen mutant, og hvis ditt valg av ulike deler: hode, torso, poter, horn og så videre er vellykket, vil monsteret ditt vinne. Etter hver seier vil nye reservedeler bli lagt til sparegrisen for å lage en ny mutant i Merge Animals - Mutant Fight.
