Ninjaen studerte lenge, og endelig er tiden inne for å bruke kunnskapen og ferdighetene hans i Dark Ninja Hanjo. Sensei informerte studenten sin om at han var klar til å starte et selvstendig liv, men samtidig ble den tidligere studenten bedt om å utføre et svært viktig oppdrag for å gjenopprette byen. Oppdraget vil vise hvor forberedt helten er. Byen er fortært av mørket, for å befri den, må du kjempe mot demoner eller besatte krigere. Ninjaen vil kunne vise hva han er i stand til. Motta instruksjoner fra læreren på det første stadiet, han vil følge eleven sin, men da må du handle på egen hånd i Dark Ninja Hanjo.
