De røde og blå stokkmennene er svorne fiender i livet, men det hendte at de begge havnet i samme fengselscelle i Stick Bros Leave Prison. De skal ikke sitte sammen og det er ikke hensiktsmessig å arrangere et oppgjør på en trang celle. Fangene bestemte seg for først å forene seg og rømme, og deretter i naturen kunne de håndtere hverandre. I mellomtiden må dere opptre sammen, akkurat som du og partneren din hvis dere spiller sammen. Du kan imidlertid spille alene og kontrollere karakterene én etter én. For å bytte fra den ene til den andre, trykk på C-tasten. Overvinn hindringer, samle nøkler for å åpne døren til et nytt nivå. Hvis en av stikkmennene mislykkes og nivået ikke er fullført, kan du gå gjennom banen hans igjen i Stick Bros Leave Prison.
