Et team av modige forskere legger ut på en romekspedisjon for å finne vennlige sivilisasjoner i Boblekastet. Under flyturen kom et visst fiendtlig stoff inn i skipet, som fylles opp med flerfargede bobler og truer med å fange skipet fra innsiden. Heltene fant ut at de kan kjempe mot invasjonen med de samme fargede ballene ved å kaste dem og lage grupper på tre eller flere identiske for senere ødeleggelse. For å fullføre et nivå i Bubble Throw må du score det nødvendige antallet poeng. Det er totalt femti nivåer i spillet, og kompleksiteten deres øker stadig.
