For fans av sjangeren flyvende fugler vil Flappy Ball 3D endre grensesnittet litt og tilby kontroll over en basketball i stedet for en fugl. Han vil ikke bare fly i luften, støttet av deg, han må også dykke ned i de røde bøylene, og dette er obligatorisk. Hvert dykk vil bli tildelt ett vinnerpoeng. Mens du flyr mellom ringene dukker det opp hjerter. Fang dem for å fylle det store hjertet på den horisontale linjen øverst. Når den er full, vil et hjerte dukke opp bak ballen, som vil følge den konstant. Hvis du savner bøylen, vil ballen forsvinne og et hjerte dukker opp som du kan kontrollere. Hvis det ikke var noe hjerte, ville Flappy Ball 3D-spillet ta slutt.