En fyr med superkreftene til Spider-Man gikk for å tjene i utenlandsk etterretning og ble en spesiell agent som James Bond. Men han trenger ikke et våpen; han takler fiendene sine. Det som frigjør et nett fra baugen og vikler fienden med det, og immobiliserer ham fullstendig. I Mutant Assassin 3D vil du hjelpe helten med å fullføre oppdrag ved å eliminere uønskede fiendtlige agenter. Ødeleggelsesmekanismen er enkel: du retter den grønne sirkelen mot den neste røde skurken og slipper nettet. Den vikler seg rundt kroppen og fienden er beseiret. På samme måte må du samle hauger med penger, de må samles inn for å fullføre nivået i Mutant Assassin 3D.