Helten i spillet Murder Case Clue 3D er en gutt som heter Tom som elsker detektivhistorier. Han har lest alle verkene om Sherlock Holmes og Hercule Poirot og vet nøyaktig hva han vil bli når han blir stor. Fyren har lenge drømt om å etterforske en ekte forbrytelse. Men hvem vil tillate ham, for han er fortsatt en tenåring. Imidlertid bringer livet av og til overraskelser. Da venner inviterte gutten til å tilbringe en helg med dem på et landsted, ante han ikke hvordan det kunne ende. Da han ankom den angitte adressen og fant ønsket hus, fant helten det tomt. Alle vennene dro for å avgi forklaringer til politiet fordi det hadde skjedd et drap i huset. Mens ingen var der, bestemte gutten seg for å etterforske hendelsen. Ingen vil stoppe ham fra å lete etter bevis, og du vil hjelpe raskt å fastslå sannheten i Murder Case Clue 3D.
