I den andre delen av MineClicker 2 vil du hjelpe karakteren din med å utforske et avsidesliggende område. Foran deg vil karakteren din være synlig på skjermen, som vil være plassert på et bestemt sted. Du må først etablere en leir. For å gjøre dette vil karakteren trenge ressurser. Du må finne dem og begynne å klikke på dem med musen. Dermed vil du trekke ut disse ressursene. Når et visst antall av dem samler seg, vil karakteren bygge en leir. Deretter vil han begynne å utforske området. På sine reiser må han kjempe mot forskjellige monstre. Å drepe dem vil gi deg poeng i MineClicker 2.