Tjeneste i en spesialstyrkeenhet innebærer muligheten for å være når som helst der de skyter og det er en reell fare for å bli drept. Men slik er arbeidet, og i Base Attack vil du igjen finne deg selv i et hot spot. Denne gangen vil du bli overført til en hemmelig base som ble angrepet av terrorister. De klarte å bryte gjennom forsvaret til vaktene og trenge gjennom korridorene som førte til bunkeren. Der må du stoppe dem og ødelegge dem. Beveg deg gjennom steinlabyrinten og så snart du finner målet, skyt umiddelbart for ikke å bli et mål selv. Før du på hvert nivå av Base Attack vil bli gitt en spesifikk oppgave.