En fyr ved navn Tom arvet en liten fabrikk som var i tilbakegang. Helten vår bestemte seg for å begynne å utvikle den. I Mega Factory-spillet vil du hjelpe ham med dette. Karakteren din vil være synlig på skjermen foran deg, som vil være plassert i et av lokalene til fabrikken. Det første du må gjøre er å gå gjennom det og se nøye på alt. Du må samle gullmynter som er spredt på gulvet i rommet. Da vil du sette fabrikkutstyret i drift. Hun vil begynne å produsere produkter som du må pakke. Du vil da laste produktet på en lastebil som skal levere det til kundene. For dette vil du motta penger. Du kan bruke dem på å kjøpe nytt utstyr til fabrikken, råvarer til arbeid og ansette ansatte. Så gradvis i spillet Mega Factory vil du organisere arbeidet til fabrikken.
