Du kjenner sikkert til fantomer eller spøkelser fra science fiction-filmer og -bøker, men heltinnen i spillet Phantom Manor ved navn Ashley har evnen til å se spøkelser, selv om dette ikke skjer så ofte. Første gang så hun et spøkelse, som dukket opp på et tidspunkt da skatter som tilhørte jentas familie ble stjålet. Siden den gang, deres slags forfølgere av fiasko, gikk de konkurs og ble tvunget til å flytte fra familiens eiendom til et lite hus. Heltinnen ønsker å gå tilbake til sitt tidligere velvære og har til hensikt å finne et fantom, hun er sikker på at han på en eller annen måte er involvert. Men for dette må hun infiltrere sitt tidligere herskapshus i Phantom Manor.
