En av koloniene med jordboere på en fjern planet har blitt invadert av ulike typer romskadedyr. Du i spillet Space Pest Annihilation må hjelpe karakteren din med å ødelegge alle skadedyrene. Foran deg på skjermen vil du se karakteren din kledd i en romdrakt. Han vil være i et bestemt område med våpen i hendene. På avstand fra ham vil du se ormer i forskjellige farger. Du må rette våpenet ditt mot dem og sikte. Ved hjelp av en spesiell skala plassert til venstre, må du beregne kraften til skuddet ditt og, når du er klar, gjøre det. Hvis du tar riktig hensyn til alle parameterne, vil ladningen fra våpenet treffe ormene og ødelegge dem. For dette vil du få et visst antall poeng i spillet Space Pest Annihilation, og du vil gå videre til neste nivå i spillet.
