Søte valper vil være hovedpersonene i Puppy Match 3. de fyller spillefeltet og vil vente på handlingene dine. En stor skala vil vises til venstre, som du ikke må fylle ut med noe, men med valper. Det vil skje slik: lag linjer med tre eller flere identiske dyr, de må være helt identiske. For å gjøre dette, må to tilstøtende valper bare byttes. Handle raskt, siden nivået i måleren vil falle katastrofalt hvis du klikker for lenge på ditt neste trekk i Puppy Match 3.