En ung sjømann må beskytte skipet sitt mot pirater i Bubble Shooter. En hel sky av flerfargede baller har konsentrert seg over skipet hans, og alle kan falle på dekk og senke skipet på et øyeblikk. For å forhindre at dette skjer, skyt slik at det er tre eller flere identiske bobler ved siden av hverandre. Dette vil ødelegge dem. Dermed vil du hjelpe helten med å eliminere trusselen. Ballen som allerede er lastet i kanonen vil skyte, og ikke den som fyren holder i hendene og står i nærheten. Dette er noen ganger forvirrende i Bubble Shooter.
