To løpere vil gå inn på banen i Magic Run 3D-spillet, og du vil kontrollere en av dem for å hjelpe ham med å vinne, og deg til å passere nivået. Helten din vil gå gjennom det første nivået alene, fordi du må bli komfortabel og forstå hvordan du skal handle og hva du skal bruke. Når du nærmer deg neste hinder, klikk på helten slik at han på magisk vis forvandler seg og passerer den enkelt. I det ene tilfellet vil han trenge styrke, og i det andre behendighet. Å klatre på høye vegger eller løpe opp ned. Etter å ha bestått treningsnivået vil du være klar for konkurransen og deretter ikke gjespe i Magic Run 3D.
