Oftest i spill av flygende fuglesjangeren, må du hjelpe en eller annen fugl med å overvinne vanskelige luftveier, fly gjennom trange hull og prøve å ikke treffe forskjellige hindringer. I Flapi Smash vil du gjøre alt i revers. Oppgaven er å ikke gå glipp av en hel flokk med fugler som ønsker å bryte gjennom nettstedet ditt. For å gjøre dette vil du klare hindringer, lukke dem hver gang en fugl prøver å skli inn i en åpen passasje. Fuglene selv har skylden, de ble forklart at det ikke er verdt å fly i denne retningen, men av en eller annen grunn hører de ikke på det, og nå klandrer de seg selv for Flapi Smash.
