Den lille musa gikk i en felle og ble fanget av folk. Nå sitter han i et bur og drømmer om frihet. Du i spillet Mouse Escape må hjelpe helten med en vågal flukt. Et bestemt område vil vises på skjermen foran deg der det vil være et bur, der musen vil sitte. Du må gå rundt på stedet og undersøke alt nøye. Se etter gjenstander som vil hjelpe helten din med å komme seg ut av buret og deretter flykte. Disse gjenstandene kan skjules på de mest uvanlige og noen ganger uventede stedene. Ganske ofte, for å komme til dem, må du løse et puslespill eller rebus. Etter å ha samlet alle gjenstandene og nøklene, vil du hjelpe musen med å komme seg ut av buret og rømme.
