Selv kjente superhelter trenger noen ganger kvalifisert legehjelp. I dag, i Superhero Hospital Emergency-spillet, ønsker vi å invitere deg til å jobbe som lege i en av klinikkene som spesialiserer seg på å hjelpe slike pasienter. En hall vil dukke opp på skjermen foran deg der pasientene dine vil sitte på en stol. Du klikker på en av dem. Etter det vil pasienten være på kontoret ditt. Først av alt må du undersøke det for å stille en diagnose. Deretter, ved hjelp av medisinske instrumenter og medisiner, vil du utføre et sett med handlinger rettet mot å behandle pasienten. Når du er ferdig er han helt frisk og du kan begynne å behandle neste pasient i Superhero Hospital Emergency-spillet.