En gruppe kuber i forskjellige farger som reiste verden rundt, falt i en felle. Heltene befant seg i en fangehull, og i spillet Zero Squares må du hjelpe dem med å komme seg ut av det. Før du på skjermen vil du se rommet der kuben din skal befinne seg. Du kan bruke kontrolltastene til å kontrollere handlingene. Et eller annet sted i rommet vil du se en portal som leder til neste nivå i spillet. Du må ta kuben langs en bestemt rute og gjøre den slik at den kommer inn i portalen. På vei kan det være hindringer som karakteren din må unngå.
