To brødre Jack og Tom reiste gjennom en magisk skog. En dag falt Tom i en magisk felle og døde. Jack ønsker å gjenopplive broren. For å gjøre dette må han finne fragmentene av sjelen sin. Du i spillet Lost Spirit vil hjelpe ham på dette eventyret. Før du på skjermen vil du se karakteren din, som vil løpe langs skogstien, gradvis få fart. På veien til helten din vil du vente på forskjellige farer som han, under din ledelse, må overvinne. Så snart du oppdager et sjeleskår, ta det opp. For dette vil du få poeng og du vil fortsette søket.