Den berømte leiesoldaten, med tilnavnet Storm, ble ansatt av den amerikanske regjeringen for å utføre et hemmelig oppdrag. Vår helt vil måtte bryte gjennom elven til fiendens militærbase og ødelegge flere høytstående sjefer der. Du i spillet Commando Boat vil hjelpe helten til å utføre denne oppgaven. Foran deg på skjermen vil du se en elv som karakteren din vil rusle på båten sin, og gradvis få fart. På veien for bevegelse vil det oppstå forskjellige slags hindringer. Ved å bruke kontrolltastene vil du tvinge båten til å gjøre manøvrer på vannet og dermed unngå kollisjon med disse hindringene. Elva patruljeres av fiendens skip og båter. Du nærmer deg dem må åpne ild for å drepe. Ved å skyte nøyaktig vil du ødelegge fiendens skip og få poeng for det. Prøv også å samle gullmynter og andre gjenstander som flyter i vannet. De gir deg poeng og kan tildele deg forskjellige nyttige bonuser.
