I vår fjerne fremtid begynte menneskeheten å utforske dypet av galaksen i et akselerert tempo. Romskip fløy i alle retninger på jakt etter planeter som passer for livet. Da en slik planet ble funnet i bane, ble det bygget en rombase. Den ble besøkt av forskerskip eller brukt som et iscenesettelsespost. I spillet Math Controller vil du styre en slik base. Din oppgave er å håndtere navigering. Basen din vil være synlig på skjermen foran deg, og sveve i rommet. Romskip vil fly mot den i forskjellige hastigheter. Din oppgave er å legge en rute for dem. Husk at de ikke må kollidere med hverandre. Når alle skipene lander på stasjonen, vil du motta poeng og gå til neste nivå i spillet.