Flerfargede bobler dukket opp over hovedstaden i undervannsriket, hvor giften ligger. De kommer gradvis ned, og hvis de berører bunnen, vil de sprekke og forgifte vannet. I Shoter Bubble vil du hjelpe en fisk som heter Tom med å ødelegge dem. En klynge av bobler vil være synlig på skjermen foran deg. Under dem vil det være en kanon installert i midten av klyngen. Hun er i stand til å skyte flerfargede enkeltladninger. Når du ser en kanonkule inne i kanonen, må du finne en kule av bobler av nøyaktig samme farge og sikte på dem for å skyte et skudd. Kjernen din som treffer disse elementene vil ødelegge dem, og du vil få poeng for dette. Dermed vil du ødelegge disse gjenstandene.
