På en av de fjerne planetene oppdaget forskerne inngangen til den gamle labyrinten. I Shy Eye Labyrinth: The Incredible Mystery må du infiltrere og utforske. Labyrinten i seg selv består av flere nivåer. Du starter reisen fra første stund. For å komme til andre etasje i labyrinten, må du finne en nøkkel som vil være gjemt et sted i fangehullet. Du må gå gjennom fangehullet og nøye undersøke alt. På vei vil du komme over forskjellige typer feller som du må omgå. Hvis du faller i fellen, vil du dø og mislykkes i oppdraget ditt.
