Agent Smith i The Matrix er en agentmodul, et dataprogram som har jaget hovedpersonen Neo. Smith kan overskrive seg selv i andre agenter, og dermed skape mange eksemplarer av seg selv. I spillet Mr Smith må helten kjempe med en hel hær av Smiths, og han kan ikke gjøre uten din hjelp. Det er nødvendig å ødelegge fiendene, siden Smith anser folk som et virus, noe som betyr at du ikke forventer nåde fra ham. På hvert nivå må du ødelegge fienden med nøyaktige skudd. Hvis han ikke er i skuddlinjen, så bruk en rikochet. Husk at helten ammunisjon er begrenset. Nummeret deres vises i øvre venstre hjørne. Lykke til.