Den lille jenta Mary bestemte seg for å besøke sine fjerne slektninger. Hun reiste seg tidlig om morgenen og kledde seg. I Mary Run vil du hjelpe henne på dette eventyret. Foran deg på skjermen vil du se veien jenta din vil løpe langs, gradvis øke hastigheten. En rekke feller og hindringer vil komme over på vei. Du må bruke kontrolltastene for å tvinge jenta til å gjøre visse handlinger. Jenta din må hoppe over fellene på veien. Hvis det er en hindring i veien hennes, kan jenta klatre opp på den. Ulike mynter og andre gjenstander vil være plassert over hele veien. Du må få jenta til å samle dem alle.
