Jelly-innbyggernes verden er stor og mangfoldig, og blant dem er det en klan av ninja-krigere. De skiller seg fra vanlige gelé med svart bandasje, mens de selv kan ha hvilken som helst farge. Denne klanen utfordrer deg også i spillet Jelly Ninja. Du må bare velge spillmodus: en stund eller mot feil. Tidsbestemt modus forutsetter at du spiller ett minutt, men det kan vare hvis du fanger en flygende vekkerklokke. I feilfri modus vil du spille til skalaen til høyre blir helt rød, og dette vil skje hvis du savner et visst antall gele før du kan klippe dem. Det er mange geléninjaer som ikke kan bekjempes med sveipet av et sverd.
