Eventyrene til Tom og Jerry kommer til det faktum at en av heltene mishief den andre, og så løper katten etter musen for ethvert utfall. I spillet Tom og Jerry Run hjelper du musen. Han er som oftest offer for urettferdighet og må stikke av. Denne gangen vil han måtte løpe langt og langt, men dette er opp til deg. Veiled helten slik at han unngår hindringer eller hopper over dem. Samle mynter og ostestykker. Du kan bruke pengene i butikken ved å kjøpe det som er på lager. Den generelle oppgaven er å få musen til å løpe så langt som mulig.
