Den neste krigen blusset opp i verdensrommet, og du kan ta del i den som sjef for en stor flåte. Oppgaven i Battle of Aliens er å vinne helt og ugjenkallelig. For å gjøre dette, må du utvikle en passende strategi og taktikk. Nederst på panelet er det et sett med skip med forskjellige ferdighetsnivåer og angrepsevner. Seier avhenger av ditt valg. Hvis du setter opp svake skip, vil fienden raskt feie dem bort, hvis du sender de tyngste og mektigste jagerflyene på en gang, kan du bryte gjennom forsvaret, men det er ikke kjent hva som ligger foran deg, og du vil ikke ha noe igjen. Derfor bør du se etter et mellomgrunn.
