Den modige ninja mottok en ordre fra sjefen for sin ordre om å trenge inn i slottet til en aristokrat og stjele dokumenter der. Du i spillet Ninja Run Up And Down vil hjelpe ham i disse eventyrene. Karakteren din må løpe til slottet langs en vei som går gjennom et visst område. På veien vil han komme over forskjellige feller og monstre. Hvis du løper opp til dem, må du tvinge helten din til å hoppe og fly gjennom luften gjennom alle disse farene.
