2020-pandemien lammet livet på alle kontinenter. Menneskeheten har ennå ikke måttet tåle en slik test, men folk vil takle, og du vil hjelpe dem på virtuelle felt. Hvis viruset i virkeligheten er usynlig, men i Covid Kill kan vi se dens lumske personlighet perfekt. Helten vår er bevæpnet med spesielle antiseptiske våpen som skyter med en desinfiserende løsning. De vil drepe de onde virusmonstrene på stedet, og vil avslutningsvis kjempe mot virusets sjef og ødelegge ham fullstendig. Gå gjennom tjue nivåer så vil viruset bli beseiret.
