Ubåten din utfører oppgaven med å beskytte statens vanngrense. Fienden kan angripe ikke bare på land, i luft, på vann, men også under vann. I spillet Mashi Deep må du avvise fem bølger av angrep. Det er hvor mye fienden har styrke nok. Ubåtflåten er ikke ubegrenset, hvis du står, vil ikke forsvaret kunne slå gjennom. Svøm og skyt, ødelegg alle i din vei. Etter neste bølge må du kjempe mot sjefen, flaggskipet, og dette er alvorlig. Hver sjef er unik med sine spesielle evner og triks.
